An in-silico approach for the evaluation of six DNA barcodes by using Maximum Likelihood (ML) and TaxonDNA approaches for some Polygalaceae
   
Yazarlar (1)
Doç. Dr. Deniz AYGÖREN ULUER Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi, Türkiye
Makale Türü Açık Erişim Özgün Makale (Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale)
Dergi Adı Erzincan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
Dergi ISSN 1307-9085
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili İngilizce Basım Tarihi 03-2021
Cilt / Sayı / Sayfa 14 / 1 / 270–283 DOI 10.18185/erzifbed.786884
Makale Linki https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/1261367
Özet
Polygalaceae kozmopolit bir yayılıma sahip, 27 cins içinde yaklaşık 1,200 türe sahip geniş bir familyadır. Ancak birçok bitki grubu gibi, Polygalaceae türlerinin tanımlanması genellikle çiçek ve meyva karakterlerine bağlıdır. Bu nedenle DNA barkodlama yontemi steril materyalin doğru tanımlanmasını sağlayabilir. Bu çalışmada altı tane yaygın olarak kullanılan DNA barkodu, rbçL, matK, trnL-F DNA bölgesi (trnL intron+trnL-F dahil), tüm ITS (ITS1+5.8S+ITS2), ITS1 ve ITS2 DNA bölgelerinin, Maximum Likelihood (ML) ve TaxonDNA yöntemleri ile DNA barkodu olarak performansları değerlendirilmiştir. Sonuçlar göstermiştir ki, altı DNA bölgesinden hiçbiri ideal değildir, ancak Polygalaceae familyası için en uygun DNA barkodu matK gen bölgesidir.
Anahtar Kelimeler