Schiff Bazı İçeren Tek Kristal Bileşik Üzerinde X-Işınları, Spektroskopik ve Moleküler Doking Çalışmaları
     
Yazarlar (3)
Prof. Dr. Tuncay KARAKURT Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi, Türkiye
Seher Meral Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Türkiye
Ayşen Alaman Ağar Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Türkiye
Makale Türü Açık Erişim Özgün Makale (Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale)
Dergi Adı Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
Dergi ISSN 1300-7688
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili Türkçe Basım Tarihi 08-2019
Cilt / Sayı / Sayfa 23 / 2 / 505–514 DOI 10.19113/sdufenbed.530279
Makale Linki http://dergipark.org.tr/doi/10.19113/sdufenbed.530279
Özet
Schiff bazı ve tiyazol halkası içeren 2,2'-((1E,1'E)-(ethan-1,2-dibis(azaneliden))bis(methaneliden))bis(4-(trifloromethoksi)fenol tek kristali buçalışmada sentezlenmiştir. Sentezlenen kristalin yapısı, IR spektroskopik ve X-ışınları analiziteknikleri kullanılarak aydınlatılmıştır. İncelenen bileşiğin fenol–imin ve keto–amin gibi ikifarklı tautomer formda olabileceği görülmüştür. Deneysel ve teorik tüm çalışmalar ikitautomer yapı üzerinde yapılmıştır. Bunun içinde bileşiğin yapısal parametreleri, GAUSSIAN09W paket programı ve DFT/B3LYP teorisi ile optimize edildikten sonra IRC (intrinsicreaction coordinate), frontier moleküler orbital(FMO) hesaplamaları yapılmıştır. IRCçalışmasında fenol-imin formunun keto-amin formuna göre daha düşük enerjiye sahipolduğu gözlenmiş olup iki form arasındaki enerji farkı -14.71 kj/mol olarak hesaplanmıştır.Ayrıca, fenol-imin ve keto-amin formlarına ait HOMO enerji değerleri sırasıyla, -6.31 ve -5.77eV olarak hesaplanmıştır. Son olarak da iki tautomer yapının antifungal aktivite çalışmalarıiçin 2RKV protein yapısına inhibitör ajan olabilmesi yönünde Moleküler Doking çalışmasıyapılmıştır. Bu hesaplama sonucunda fenol-imin ve keto-amin formuna ait affinite değerleri(Doking skoru) sırasıyla, -7.7 ve -7.3 kcal/mol olarak elde edilmiş olup HOMO orbitalenerjileri ile affinite değerlerinin orantılı olduğu çalışmamızda gözlenmiştir.
Anahtar Kelimeler