| Yazarlar |
Dr. Öğr. Üyesi Sevinç AKÇAY
Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi, Türkiye |
| Özet |
| Pulmoner arteriyel hipertansiyon (PAH), pulmoner arterlerde yüksek hipertansiyon ile işaretlenmiş kronik bir kardiyopulmoner bozukluktur. PAH hastalığı için kesin bir tedavi yöntemi yoktur, mevcut ilaçlar ise sadece hastalığın ilerlemesini azaltmaya yardımcı olabilir. Bu araştırma, biyoinformatik analiz yoluyla PAH'ın potansiyel protein ve RNA biyobelirteçlerini araştırmayı amaçlamıştır. Herkese açık Gene Expression Omnibus (GEO) veri tabanından erişilen iki PAH veri seti, diferansiyel olarak eksprese edilmiş genleri (DEG'ler) belirlemek için kullanıldı. Yaygın DEG'ler için Gen Ontoloji (GO) ve Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) yolak analizleri DAVID aracıyla yapıldı. Cytoscape, protein-protein etkileşimini (PPI) oluşturmak ve ilk 10 aday genini seçmek için kullanıldı. DEG'leri ve hub genlerini hedefleyen transkripsiyon faktörleri (TF'ler) ve mikroRNA'lar (miRNA'lar), JASPAR veri tabanı kullanılarak araştırıldı. En iyi ilk 10 aday geni hedefleyen potansiyel terapötikler DGIdb veritabanı ile araştırıldı. On aday geninin PAH patogeneziyle bağlantılı olduğu bulundu (CCL5, TLR4, TLR1, SPP1, CYBB, HGF, IGF1, SELL, CD163 ve POSTN). “Tümör nekroz faktörü biyosentetik sürecinin pozitif regülasyonu” ve “TOLL benzeri reseptör sinyal yolu” sırasıyla en zenginleştirilmiş GO terimi ve KEGG yolağıdır. “hsa-mir-26b-5p, hsa-mir-146a-5p, hsa-mir-335-5p” ve FOXC1, YY1, GATA2, aday genlerini hedefleyen en iyi TF'lerdir. On aday geni hedef alan 21 ilaç belirlendi. Sonuçlarımız, PAH hastaları için protein ve RNA seviyelerinde potansiyel terapötik hedefler olarak hizmet edebilecek PAH ve aday genleri, miRNA'lar ve on TF'nin patogenezini belirlemeye yardımcı olacaktır. |
| Anahtar Kelimeler |
| Makale Türü | Özgün Makale |
| Makale Alt Türü | Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayımlanan tam makale |
| Dergi Adı | Düzce University Journal of Science & Technology |
| Dergi ISSN | 2148-2446 |
| Dergi Tarandığı Indeksler | TR DİZİN |
| Makale Dili | İngilizce |
| Basım Tarihi | 10-2023 |
| Makale Linki | https://dergipark.org.tr/tr/pub/dubited/issue/80489/1103902 |
