| Yazarlar |
Şenol Alan
Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi, Türkiye |
|
Tuğba Sarışahin
|
|
Aydan Acar Şahin
Ankara Üniversitesi, Türkiye |
|
Ayşe Kaplan
Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi, Türkiye |
Dr. Öğr. Üyesi İbrahim ERDOĞAN
Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi, Türkiye |
|
Nur Münevver Pınar
Ankara Üniversitesi, Türkiye |
| Özet |
| Amaç: Atmosferdeki polen, küf sporları, bakteriler ve virüsler alerjik semptomlara ve hastalıklara neden olan temel biyolojik maddelerdir. Polen ve sporların ayırt edilmesi oldukça zaman almakta ve eğitimli uzman gerektirmektedir. Bu maddelerin teşhisi için mikroskobik analiz gibi farklı yaklaşımlar bulunmaktadır. Bununla beraber, son zamanlarda bunların DNA temelli teşhisi popüler hale gelmiştir. Bu çalışmada Yüksek hacimli hava örnekleyicisinden (HVAS) elde edilen örneklerde trnT-F cpDNA’ya özgü primerler kullanılarak amplifiye edilen DNA miktarı ile Burkard tuzağı ile toplanan Poaceae polen konsantrasyonu arasındaki korelasyon değerlendirildi. Gereç ve Yöntem: Burada, tek aşamalı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tekniği kullanılarak havadaki Poaceae poleni tanımlamak ve ölçmek için bir yöntem sunulmuştur. HVAS tarafından toplanan kırk günlük örneklerde, iki farklı yöntem optimize edildi ve trnT-F cpDNA bölgesi, Poaceae’ye özgü bir primer çifti kullanılarak çoğaltıldı. DNA ve polen konsantrasyonu arasındaki korelasyon, R istatistik programlama dili kullanılarak test edildi. Bulgular: M1 ve M2 yöntemleri arasında anlamlı bir korelasyon olmasına rağmen (R2 = 0,655, p < 0,01), M2 yöntemi polen konsantrasyonu ile daha fazla ilişkiliydi. Polen ve DNA içeriği arasındaki korelasyon, polen mevsiminde gözlenen bölümler nedeniyle değişiklik göstermiştir. M2 yöntemi kullanılarak PCR verilerinden elde edilen DNA konsantrasyonları ile ışık mikroskobu ile belirlenen polen konsantrasyonları arasında hem II. Bölümde (R2 = 0,767, p < 0,01), hem de tüm sezon boyunca (R2 = 0,469, p < 0,01) önemli derecede ilişki bulunmuştur. Sonuç: M2 yöntemi, Zonguldak ili atmosferinden elde edilen karışık örneklerdeki Poaceae polenlerinin doğru bir şekilde belirlemiştir. Kodlanmayan trnT-F cpDNA bölgesi ilk kez aerobiyolojik örneklerdeki Poaceae polenlerini belirlemek için kullanılmıştır. DNA özütlemesi gerektirmeyen bu metodun kullanımı ileride geliştirilecek eş zamanlı polen izleme cihazlarının önemli bir adım olabilir. Polen ve çoğaltılan DNA içeriği arasındaki ilişkinin kuvveti daha düşük emme kapasitesine sahip bir örnekleyici ve qPCR gibi daha hassas bir tekniğin kullanımıyla arttırılabilir |
| Anahtar Kelimeler |
| Makale Türü | Özgün Makale |
| Makale Alt Türü | SSCI, AHCI, SCI, SCI-Exp dergilerinde yayımlanan tam makale |
| Dergi Adı | Turkish Journal of Biochemistry |
| Dergi ISSN | 1303-829X |
| Dergi Tarandığı Indeksler | SCI |
| Makale Dili | İngilizce |
| Basım Tarihi | 06-2018 |
| Cilt No | 44 |
| Sayı | 3 |
| Sayfalar | 248 / 253 |
| Doi Numarası | 10.1515/tjb-2018-0020 |
| Makale Linki | http://www.degruyter.com/view/j/tjb.2019.44.issue-3/tjb-2018-0020/tjb-2018-0020.xml |
| Atıf Sayıları |
