| Proje Ekibi |
Dr. Öğr. Üyesi Merve ULUKAPI
Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi, Türkiye Projedeki Rolü: Bursiyer |
| Proje Türü | TÜBA ve TÜBİTAK Destekli Proje |
| Proje No | - |
| Proje Konusu | Bu çalışmada in vitro olarak geliştirilen Pyrenophora teres f. maculata izolatlarından (iki yüksek virülensliğe sahip ve iki düşük virülensliğe sahip) bütün ökaryotik organizmalarda protein sentez, katlanma ve kalite kontrol gibi proseslerde ve ayrıca lipid ve sterollerin biyosentezi için önemli organel olan Endoplazmik Retikulum (ER) izole edilerek, gradyent santrifügasyon yöntemi ile saflaştırılacaktır. Bu saflaştırmada total ER, granüllü ER ve düz ER kısımları saf olarak elde edildikten sonra organel fragmanlarından total protein ekstraksiyonu yapılarak iki boyutlu jel elektroforezi (2-DE) ile proteinlerin ayrımı gerçekleştirilecektir. Daha sonra 5 biyolojik tekrarda ortak olan protein spotları jelden kesilip tripsin ile muamele edildikten sonar oluşturulan triptik peptidlerin nano-LC-MS/MS ile analizlenmesi sonucu tanımlanacaklardır. Biyo informatik analizleri ile tanımlanan proteinlerin lokalizasyonunun ve sinyal peptidi içerip içermediği, transmembran domainlerinin varlığı, protein protein etkileşimleri belirlenecek ve istatistiksel analizlerle çalışılacak olan ER fragmanlarının her birine spesifik olan ve her ikisinde de var olan proteinlerin varlığı tespit edilecektir |
| Proje Durumu | Tamamlandı |
| Başlangıç Tarihi | 16-06-2017 |
| Bitiş Tarihi | 08-07-2022 |
